男人精子畸形率97的确会影响怀孕，这种情况可以做试管婴儿，但精子畸形率达到了97%的确是会对试管成功率产生一定程度上的影响：
一、精子头部畸形
头部畸形很有可能会影响胚胎质量，导致胚胎可用率低下或者优质胚胎率低下，自然就会会影响试管成功率。如果反复多次不怀孕或者生化妊娠，建议囊胚移植。
二、精子尾部畸形
尾部畸形理论上对试管成功率影响不大，但实际上还是比形态正常精子的妊娠率差。
所以男方在试管婴儿前还是要做好充足的准备。
畸形率超过97%做试管还是有希望的，也是能挑出来好的精子的，因为通过400条精子抽样检查，畸形率97%不代表整份精液内没有一条形态正常的精子，通过胚胎实验室的挑选，可以在整份精液中挑选出形态好的活精子，用于做试管。
但引起精子畸形率的病因能同时导致精子所携带的遗传物质异常，遗传物质异常是会导致胚胎发育质量差，胎停与自然流产的风险相对增加。怎么申请供卵
因此对于畸形精子患者，应该重视病因分析，对症治疗后再考虑或者选择第三代试管婴儿，通过PGS或PGD技术筛选出正常的胚胎进行移植，从而最大程度的保证生出健康的后代。
一般来说，正常男性精液中的精子畸形率应该低于30%，若畸形率高于50%则称为高畸形率精子，对男性的生育能力造成一定影响。精子畸形率越高对男性的危害越大，不仅会影响性生活，还会影响受精能力，导致不育，所以如果男性精子畸形率比较高，务必尽快进行调理。